熒光顯微鏡，是從生物或非生物樣品熒光?-?磷光通過觀察現象，觀察目標顯微鏡是。有時會同時觀察到反射光或透射光圖像。用于生物學?/?醫學研究，臨床測試和滲透測試。

普通光學顯微鏡，但做觀察的光源如鎢鹵素燈，用于觀察與熒光的樣品的熒光顯微鏡超高壓水銀燈和氙燈、紫外線LED、激光通過使用熒光它可以在材料的激發波長下進行照明。

激發光的紫外線鄰近如（UV激發·334 / 365nm）下·藍色光（B激發·435分之405/ 490nm處）·綠色光（G激發·546納米）被使用。通常使用超高壓汞燈作為激發光源。這是因為可以進行紫外線的激發。由于其工作原理，超高壓水銀燈需要專用的高壓電源，并且還需要定期更換水銀燈泡。因此，近年來，以小型化和易于維護為目的，開發了使用紫外線LED的產品。

在使用紫外線的情況下，可能會對人體造成不良影響，因此，通過在紫外線的散射部位附近設置紫外線截止濾光片，可以保護人體。超高壓水銀燈發出的光含有UV-C，對人體特別有害。

在結構上，它大致分為透射型熒光顯微鏡和落射照明型熒光顯微鏡。透射熒光顯微鏡具有更簡單的結構并且具有悠久的歷史，但是如今，由于技術上的創新，主要使用了具有許多改進性能的余輝熒光顯微鏡。

• 與普通光學顯微鏡（生物顯微鏡）一樣，從下方照射激發光。此時，在光源上安裝濾光片（激發濾光片），僅照射激發光的波長。
• 使用暗場聚光器以激發光照射樣品制備
• 只有樣品產生的熒光和樣品散射的激發光才能到達目鏡。
• 使用僅透射目標熒光波長的濾光器（吸收濾光器），僅提取熒光。
• 觀察熒光

• 以落射照明（同軸照明）照射激發光。二向色鏡用作落射照明的反射鏡（可以將激發濾光片用作輔助鏡），并且僅以激發光的波長照射樣品。
• 只有樣品產生的熒光和樣品散射的激發光才能到達目鏡。
• 使用僅透射所需熒光波長的吸收濾光片僅提取熒光。
• 觀察熒光

透射熒光顯微鏡結構簡單且價格便宜，但是增加激發光的強度是有局限的，不能與相襯觀察相結合，厚樣品在目鏡側產生熒光。現在，落射照明熒光顯微鏡已經成為主流，因為相關的光學技術由于其制造難度而進行了革新。通過更改光源，某些顯微鏡與透射和落射照明觀察方法兼容。

原理用紫外線穿過物鏡的激勵光，以執行激勵具有紫外線的高透光率，由透鏡材料的熒光的產生（自發熒光，下同）以下的物鏡是必要的。為此目的開發的物鏡稱為Fluor（熒光劑/熒光劑，在德語中是指螢石）。

作為用于熒光觀察的特殊染色方法，進行熒光染色、化學熒光染色、抗體熒光染色等。

在熒光染色中，使用對各細胞器，pH?/?離子等具有高染色特異性的熒光染料進行熒光染色。在某些情況下，使用多種熒光染料并對每個器官染色（多次染色）。作為熒光染料，使用DAPI，若丹明，熒光素和相關化合物。除化學物質外，還根據顆粒大小使用具有各種熒光特性的量子點進行染色。

在抗體熒光染色中，使用抗原-抗體反應，并且將用熒光染料標記的抗體（熒光標記）摻入樣品中并進行染色。由于可以對抗原物質進行高特異性染色，因此可用于臨床檢查。

如果要照射的激發光的強度太高，這些熒光染料可能會褪色。因此，采取諸如降低激發光的強度或添加抗褪色劑的措施。

在化學熒光染色中，將樣品用試劑處理以轉化為熒光物質，并觀察熒光部分。

另一種方法是引入通過遺傳重組誘導諸如綠色熒光蛋白（GFP）的熒光蛋白的基因，并對其進行觀察。（這在報告基因中有詳細說明）

樣品產生的熒光通常對激發光非常微弱，因此有必要使觀察位置變暗以提高信噪比。近年來，通過使用諸如冷卻的CCD照相機的觀察裝置進行長時間曝光和觀察極弱的熒光的圖像處理，可以獲得高分辨率和對比度。

根據樣品的不同，熒光可能會從要觀察的部位以外的地方產生，這可能會變成背景噪音并干擾觀察。這種現象稱為“自發熒光”。在生物樣品中特別成問題的包括葉綠素?b、膠原蛋白、原纖蛋白、黃素、吲哚胺、NADH、NADPH、多酚、色氨酸等。為了消除該現象，可以采用化學去除目標物質或在該物質不發熒光的波長下進行激發的方法。

除了樣品中混入的物質外，載玻片、蓋玻、浸油的油以及顯微鏡中使用的透鏡材料也可能引起自發熒光。使用熒光弱的樣品時，需要使用低熒光玻璃的載玻片/蓋玻片。

共聚焦激光顯微鏡是可以通過用具有激發波長的激光進行多階段掃描照射并合成所獲得的熒光來獲得非常深的景深的顯微鏡。結果，可以觀察到樣品的三維結構。

全內反射熒光顯微鏡是漸逝場使用進行局部激勵，也能夠淺場的非常深度。在某些情況下，可以觀察到單個熒光分子的行為，從而促進了單分子細胞生物學和生理學的發展。