植物病理學，是科學研究的疾病中的植物引起的病原體（傳染性生物體）和環境條件（生理因素）。生物體引起的傳染病包括真菌、卵菌、細菌、病毒，類病毒、病毒樣生物、植原體、原生動物、線蟲和寄生的植物。不包括諸如昆蟲的外寄生物、食用植物組織而影響植物健康的螨蟲、脊椎動物或其他害蟲。植物病理學還涉及病原體識別、疾病病因、疾病周期、經濟影響、植物病流行病學、植物病抗性、植物病如何影響人和動物、病理系統遺傳學和植物病管理的研究。

控制植物病害對于可靠地生產食物至關重要，它在農業使用土地、水、燃料和其他投入物方面也帶來了重大問題。自然和耕種種群中的植物都具有固有的抗病性，但是有許多破壞性植物病害的例子，例如愛爾蘭大饑荒和栗子枯萎病，以及反復發生的嚴重植物病害，例如稻瘟病、大豆孢囊線蟲和柑桔。

但是，大多數作物的病害控制都相當成功。通過使用對多種疾病具有良好抗性的繁殖植物以及作物輪作，使用無病原體種子，適當的播種日期和植物密度，控制田間水分和農藥等植物栽培方法，可以實現疾病控制。需要植物病理學科學的不斷進步來改善疾病控制，并跟上植物病原體的不斷進化和移動以及農業實踐的變化所引起的疾病壓力的變化。

植物病害給全球農民造成重大經濟損失。據估計，在大區域和許多農作物中，在較發達的環境中，疾病通常會使植物單產每年降低10％，但在較不發達的環境中，疾病的產量損失往往超過20％。在糧食和農業組織估計，病蟲害負責農作物損失約25％。為了解決這個問題，需要新的方法來及早發現病蟲害，例如檢測植物氣味和光譜的新型傳感器以及能夠診斷植物健康和新陳代謝的生物光子學。

大多數植物致病真菌均屬于子囊菌和擔子菌。真菌通過產生孢子和其他結構在性和無性兩方面繁殖。孢子可以通過空氣或水傳播很長的距離，也可以是土壤傳播的。許多居住在土壤中的真菌能夠腐生生活，在土壤中進行其生命周期的一部分。這些是兼性腐生。真菌疾病可通過使用殺真菌劑和其他農業實踐加以控制。然而，新的種族真菌往往演變對各種殺菌劑有抵抗力。滋養性真菌病原體定居在活的植物組織中，并從活的宿主細胞中獲取營養。壞死性真菌病原體感染并殺死宿主組織，并從死亡的宿主細胞中提取營養。重要的真菌植物病原體包括：

• 鐮刀菌屬?（枯萎病）
• 硫桿菌屬?（腐爛、黑根腐爛、Thielaviopsis根腐爛）
• 黃萎病菌
• 稻瘟病（稻瘟病）
• 核盤菌核盤菌（棉花腐爛）

• 烏頭藻屬?（黑穗病）大麥黑穗病
• 根瘤菌屬
• Phakospora pachyrhizi（大豆銹病）
• Puccinia?spp。（谷物和草類的嚴重銹蝕）
• 蜜環菌屬?（蜂蜜真菌種類，樹木的致病菌）

該卵菌的真菌類有機體。包括一些xxx破壞性的植物病原體包括屬?疫，其中包括的致病因子馬鈴薯晚疫病和橡樹猝死。卵菌的特定種類引起根腐病。

盡管與真菌沒有密切關系，卵菌已發展出相似的感染策略。卵菌體能夠使用效應蛋白來關閉植物在其感染過程中的防御能力。

• 細胞壁降解酶：用于分解植物細胞壁以釋放內部營養。
• 毒素：毒素可以是非寄主特異性的，會損害所有植物，也可以是寄主特異性的，僅對寄主植物造成損害。
• 效應蛋白：通常可以通過三型分泌系統將它們分泌到細胞外環境中或直接分泌到宿主細胞中。已知一些效應子抑制宿主防御過程。這可以包括：減少植物的內部信號傳導機制或減少植物化學物質的產量。細菌，真菌和卵菌素以這種功能而聞名。

孢子：植物病原性真菌的孢子可能是宿主植物感染的來源。孢子首先粘附在宿主植物的葉子和莖的表皮層上。為了使這種情況發生，必須從病原體來源運輸傳染性孢子，這種病菌是通過風，水和諸如昆蟲和人類等媒介傳播的。當存在有利條件時，孢子會產生一種被稱為胚芽管的修飾菌絲。該胚芽管隨后形成一個稱為腹壁的隆起，該隆起形成黑色素的細胞壁，以建立突突壓力。一旦積累了足夠的膨脹壓力，外膜就以硬化的穿透釘的形式向表皮層施加壓力。該過程還通過食堂分泌細胞壁降解酶而得到幫助。一旦穿透釘進入宿主組織，它就會發育出一種稱為菌絲的專門菌絲。根據病原體的生命周期，這種吸痰器可以侵入并喂養細胞內的相鄰細胞，也可以存在于宿主細胞內。

非生物疾病可以由干旱、霜凍、雪和冰雹等自然過程引起; 洪水和排水不良；營養缺乏 ; 礦物鹽的沉積，如氯化鈉和石膏 ; 刮風和暴風雨破壞。人為干預可能引起類似的疾病（通常被歸類為非生物疾病），從而導致土壤壓實、空氣和土壤污染、灌溉和道路撒鹽導致鹽堿化、過度使用除草劑、笨拙的處理方式（例如割草機對樹木的損壞）和故意破壞行為。

流行病學：影響傳染病爆發和傳播的因素的研究。

疾病四面體（疾病金字塔）最能捕獲與植物病害有關的元素。該金字塔以疾病三角為基礎，由諸如宿主，病原體和環境等元素組成。除了這三個要素之外，人和時間會增加其余要素來制造疾病四面體。

歷史：基于巨大的損失，歷史上已知的植物病流行：

-愛爾蘭馬鈴薯晚疫病

-荷蘭榆樹病

-北美栗子疫病

影響流行病的因素：

寄主：抵抗力或敏感性水平、年齡和遺傳學。

病原體：接種量、遺傳學和繁殖類型