• 三重螺旋

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    什么是三重螺旋

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    在幾何學和生物化學領域,三重螺旋(多個三重螺旋)是一組三個相同的幾何螺旋,它們具有相同的軸,但沿軸的平移度不同。這意味著每個螺??旋線與中心軸保持相同的距離。與單螺旋一樣,三螺旋可以通過其螺距,直徑和慣用性來表征。三螺旋的實例包括三鏈DNA、三聯RNA的膠原螺旋膠原蛋白蛋白

    三重螺旋的結構

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    三重螺旋之所以這樣命名,是因為它由三個獨立的螺旋組成。這些螺旋中的每一個共享相同的軸,但是它們不占用相同的空間,因為每個螺旋都圍繞該軸成角度地平移。通常,三重螺旋的身份取決于組成它的螺旋類型。例如:由膠原蛋白的三股三股螺旋是膠原的三股螺旋,和由三股三股螺旋DNA是一個DNA的三螺旋。

    三重螺旋

    與其他類型的螺旋一樣,三重螺旋也具有慣用性:慣用右手或慣用左手。右手螺旋從頭到尾沿順時針方向繞其軸移動。左手螺旋是右手螺旋的鏡像,它從頭到尾沿逆時針方向繞軸移動。螺旋分子的起點和終點是根據分子中某些不容易改變的標記定義的。例如:螺旋蛋白的開始是其N末端,而DNA單鏈的開始是其5'末端。

    該膠原蛋白的三螺旋結構是進行了三次膠原蛋白多肽,其中每一個都形成自己的左手聚脯氨酸螺旋的。當三個鏈合并時,三重螺旋采用右手方向。膠原蛋白肽由Gly?-XY?的重復序列組成,第二個殘基(X)通常是Pro,第三個殘基(Y)是羥基脯氨酸。

    DNA三重螺旋由三個獨立的DNA鏈組成,每個鏈均以螺旋外部的糖/磷酸酯主鏈和螺旋內部的堿基為導向。堿基是分子中最接近三螺旋軸的部分,主鏈是分子中最遠離軸的部分。第三鏈占據相對正常的雙鏈DNA的主要溝。根據Hoogsteen堿基配對方案,三鏈DNA中的堿基排列成匹配。同樣,由于單鏈RNA與RNA雙鏈體形成氫鍵,形成了RNA三螺旋。雙鏈體由Watson-Crick堿基配對組成,而第三條鏈通過Hoogsteen堿基配對結合。

    穩定因素

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    膠原蛋白三螺旋具有幾個增加其穩定性的特性。當脯氨酸被摻入到Gly-XY序列的Y位置時,它被翻譯后修飾為羥脯氨酸。羥脯氨酸可以與水形成良好的相互作用,從而穩定三螺旋,因為Y殘基在三螺旋結構中是溶劑可及的。各個螺旋也通過在鏈之間形成的廣泛的酰胺-酰胺網絡保持在一起,每個鏈對三重螺旋的總自由能貢獻約-2 kcal / mol。超螺旋的形成不僅保護了螺旋內部的關鍵甘氨酸殘基,而且還保護了整個蛋白質免受蛋白水解作用。

    三重螺旋DNA和RNA由許多穩定雙鏈DNA螺旋的相同力穩定。核苷酸堿基靠近螺旋軸的內部,靠近螺旋軸、堿基與其他堿基進行氫鍵結合。中心的鍵合堿基不包含水,因此疏水作用在穩定DNA三重螺旋中尤為重要。

    生物作用

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    蛋白質

    膠原超家族的成員是細胞外基質的主要貢獻者。三重螺旋結構通過提供極大的抗拉應力,為膠原纖維提供強度和穩定性。膠原纖維的剛性是可以承受大多數機械應力的重要因素,使其成為大分子轉運和整個身體整體結構支持的理想蛋白質。

    DNA

    有一些寡核苷酸序列,稱為三聯體形成寡核苷酸(TFO),可以與更長的雙鏈DNA分子結合形成三鏈體。TFO可以使基因失活或幫助誘導突變。TFO只能與較大分子中的某些位點結合,因此研究人員必須首先確定TFO是否可以與目標基因結合。

    RNA

    近年來,對三鏈RNA的生物功能的研究越來越多。一些作用包括增加穩定性、翻譯、影響配體結合和催化作用。受到三重螺旋影響的配體結合的一個例子是在SAM-II 核糖開關中,其中三重螺旋產生一個結合位點,該結合位點將xxx地接受S-腺苷甲硫氨酸(SAM)。核糖核蛋白復合物端粒酶,負責復制DNA的末端(端粒),也含有三鏈RNA,這被認為是端粒酶正常運行所必需的。MALAT1?3'末端的三重螺旋通過保護Poly-A尾免于蛋白水解作用來穩定RNA,并提高翻譯效率,這最終對人類有害,因為MALAT1與肺癌惡性腫瘤有關。

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    詞條目錄
    1. 什么是三重螺旋
    2. 三重螺旋的結構
    3. 穩定因素
    4. 生物作用
    5. 蛋白質
    6. DNA
    7. RNA

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