在化學， 有機化合物通常為任何化學化合物含有碳氫鍵。由于碳的能力鏈狀（形成鏈與其它碳原子），數以百萬計的有機化合物是已知的。對有機化合物的性質，反應和合成的研究包括被稱為有機化學的學科。由于歷史原因，一些類型的含碳化合物（例如，碳酸鹽陰離子鹽和氰化物鹽）以及少數其他例外情況（例如二氧化碳）未歸類為有機化合物，而是被視為無機化合物。除了剛剛提到的那些化合物外，化學家之間幾乎沒有共識，確切地排除了哪些含碳化合物，從而使對有機化合物的任何嚴格定義都難以捉摸。

盡管有機化合物僅占地殼的一小部分，但它們至關重要，因為所有已知的生命都基于有機化合物。生物通過過程網絡（碳循環）將無機碳化合物結合到有機化合物中，過程網絡是通過自養生物利用光（光合作用）或其他方法將二氧化碳和氫源（如水）轉化為單糖和其他有機分子的過程能量來源。大多數合成生產的有機化合物最終都來自主要由烴組成的石油化工產品，它們本身是由地質時期xxx下有機物的高壓和高溫降解形成的。?盡管有這種最終的推論，但有機化合物已不再像從前那樣被定義為起源于生物的化合物。

有機化合物可以以多種方式分類。天然化合物與合成化合物之間的主要區別是。有機化合物也可以歸類或由存在細分的雜原子，例如，有機金屬化合物，其特征碳和之間的鍵的金屬，和有機磷化合物，其特征鍵的碳和一個之間。

根據有機化合物的大小，另一個區別是小分子和聚合物。

天然化合物是指植物或動物產生的化合物。其中許多仍然是從自然資源中提取的，因為它們人工生產會更加昂貴。示例包括大多數糖，一些生物堿和萜類化合物，某些營養物質（例如維生素B?_12），以及通常在生物體中以合理濃度存在的具有大分子或立體復雜分子的天然產物。

在最重要的其它化合物生物化學是抗原，碳水化合物、酶、激素、脂類和脂肪酸、神經遞質、核酸、蛋白質、肽和氨基酸、外源凝集素、維生素，以及脂肪和油。

通過其他化合物反應制備的化合物稱為“合成的”。它們既可以是已經在植物或動物中發現的化合物，也可以是不是天然存在的化合物。

大多數聚合物（包括所有塑料和橡膠的類別）是有機合成或半合成化合物。

許多有機化合物（例如乙醇和胰島素是兩個例子）是使用細菌和酵母等生物在工業上生產的。通常，生物體的DNA被改變以表達該生物體通常不產生的化合物。許多這樣的生物技術工程合成的化合物以前在自然界中不存在。

• 在CAS數據庫是對有機化合物的數據最全面的資料庫。提供了搜索工具SciFinder。
• 該貝爾斯坦數據庫包含980萬種物質的信息，涵蓋了從1771年科學文獻到現在，并且今天是通過訪問Reaxys。參照原始文獻，每種物質都有其結構和多種多樣的物理和化學特性。
• PubChem包含1,840萬種化合物的條目，尤其涉及藥物化學領域。

對于有機化學的不同分支，存在許多更專業的數據庫。