冷藏集裝箱或冷藏箱是聯運集裝箱中使用的（運輸集裝箱）運輸貨物的運輸，其能夠制冷對溫度敏感，易腐貨物的運輸，如水果、蔬菜、肉類和其它類似的項目。

雖然冷藏箱將有一個完整的制冷裝置，但它們依賴于外部電源，來自陸基、集裝箱船或碼頭的電源點（“冷藏點”）。當通過拖車或鐵路貨車在公路上運輸時，它們可以由柴油發電機（“發電機組”）提供動力，柴油發電機在公路旅行時連接到集裝箱。冷藏容器能夠控制從-65°C(-85°F)到40°C(104°F)的溫度范圍。

一些冷藏箱配備了水冷系統，如果冷藏箱存放在沒有足夠通風的船舶甲板下方，則可以使用該系統來去除產生的熱量。

從貨艙帶走熱量的水冷系統比氣流通風更昂貴，并且水冷系統的使用正在減少。風冷和水冷通常結合使用。

冷藏集裝箱對社會的影響是巨大的，讓世界各地的消費者可以在一年中的任何時候享用新鮮農產品，并體驗以前無法從世界許多其他地方獲得的新鮮農產品。

有時在行程時間較短的情況下使用的另一種制冷系統是全損耗制冷，其中使用冷凍的二氧化碳冰（或有時是液氮）進行冷卻。低溫冷凍的氣體緩慢蒸發，從而冷卻容器并從中排出。只要系統中有可用的冷凍氣體，容器就會被冷卻。這些已在軌道車中使用多年，可提供長達17天的溫度調節。雖然冷藏集裝箱在航空運輸中并不常見，但通常使用全損耗干冰系統。這些集裝箱有一個裝有固體二氧化碳的腔室，溫度由恒溫控制的電風扇調節，空運版本旨在保持溫度長達100小時左右。

配備這些“低溫”系統的全尺寸聯運集裝箱可以在海上運輸所需的30天內保持其溫度。由于它們不需要外部電源，因此低溫冷藏集裝箱可以存放在任何可以容納“干燥”（未冷藏）海運集裝箱的船只上的任何地方。