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蘇氨酸蛋白酶
編輯蘇氨酸蛋白酶是一個蛋白水解酶家族,在活性位點內含有蘇氨酸(Thr)殘基。這類酶的原型成員是蛋白酶體的催化亞基,但酰基轉移酶會聚進化出相同的活性位點幾何結構和機制。
蘇氨酸蛋白酶的機制
編輯蘇氨酸蛋白酶使用其N端蘇氨酸的仲醇作為親核試劑進行催化。蘇氨酸必須是N末端,因為相同殘基的末端胺通過極化有序水而起到一般堿的作用,從而使醇去質子化以增加其作為親核試劑的反應性。
催化分兩步進行:
- 首先親核試劑攻擊底物形成共價酰基酶中間體,釋放xxx個產物。
- 其次,中間體被水水解以再生游離酶并釋放第二產物。
- 在鳥氨酸酰基轉移酶中,底物鳥氨酸(受體)代替水進行第二次親核攻擊,因此與酰基一起離開。
蘇氨酸蛋白酶的分類與演化
編輯蘇氨酸蛋白酶向相同N端活性位點組織的進化收斂。顯示的是蛋白酶體(PB族,T1族)和鳥氨酸乙酰轉移酶(PE族,T5族)的催化蘇氨酸。另見:催化三聯體
目前已識別出屬于兩個獨立超家族的五個家族:Ntn折疊蛋白體(超家族PB)和DOM折疊鳥氨酸酰基轉移酶(超家族PE)。這兩個超家族代表了同一活動位點的兩個獨立的、趨同的演化。
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