需要對果樹進行授粉以產生帶有周圍果實的種子。這是將花粉從花藥轉移到柱頭的過程，無論是在同一朵花中還是在另一朵花中。一些樹種，包括許多果樹，不通過自花授粉產生果實，因此在果園中種植授粉樹。

授粉過程需要花粉載體，可以是動物、風或人為干預（通過人工授粉或使用花粉噴霧器）。異花授粉產生的種子與親本植物具有不同的基因組成；此類種子可能是作為具有所需屬性的果樹選擇性育種計劃的一部分而有意創造的。異花授粉或通過昆蟲授粉授粉的樹木比僅自花授粉的樹木產生更多的果實。在果樹中，蜜蜂是形成果實的授粉過程的重要組成部分。

數百年來，人們對世界各地果樹的授粉進行了高度研究。人們對溫帶氣候下的果樹授粉知之甚少，但對熱帶氣候下的果樹授粉知之甚少。來自溫帶氣候的水果包括蘋果、梨、李子、桃子、櫻桃、漿果、葡萄和被認為是干果的堅果。來自熱帶氣候的水果包括香蕉、菠蘿、木瓜、百香果、鱷梨、芒果和柑橘屬的成員。

大多數蘋果植物/樹木是自交不親和的，也就是說，當它們從同一棵樹的花或同一品種的另一棵樹上授粉時不會結出果實，必須進行異花授粉。少數被描述為“自花授粉”并且能夠自花授粉，盡管即使是那些在從合適的授粉劑異花授粉時也傾向于攜帶較大的作物。相對較少的品種是“三倍體”，這意味著它們幾乎不為自己或其他蘋果樹提供可行的花粉。可以相互授粉的蘋果按開花時間分組，因此異花授粉者同時開花。授粉管理是蘋果栽培的重要組成部分。種植前，重要的是要安排授粉劑——提供豐富、可行和相容花粉的蘋果或海棠品種。果園塊可以交替排列兼容的品種，或者可以種植海棠樹，或者嫁接在海棠的枝條上。有些品種產生的花粉很少，或者花粉是不育的，所以這些不是好的授粉劑。優質苗圃有授粉劑兼容性清單。擁有單一品種老果園塊的種植者有時會在鼓中提供海棠花花束或在果園里用桶裝授粉劑。擁有一棵樹且附近沒有其他品種的家庭種植者可以在較小的規模上做同樣的事情。

在每個季節開花期間，商業蘋果種植者通常會提供傳粉媒介來攜帶花粉。蜜蜂蜂箱在美國最常用，可以與收費提供蜂箱的商業養蜂人進行安排。蜜蜂屬的蜜蜂是蘋果樹最常見的授粉媒介，盡管在野外為蘋果樹授粉的是Andrena、Bombus、Halictus和Osmia屬的成員。孤獨的蜜蜂或野蜂，例如地面筑巢的采蜂（Andrena）)可能在授粉過程中發揮的作用比以往懷疑的要大得多，并且是果園中的替代授粉者。大黃蜂有時會出現在果園中，但通常數量不足以成為重要的傳粉者；在只有幾棵樹的家庭花園中，它們的作用可能要大得多。蘋果種植者還依靠幾種野生蜜蜂在他們的果園中授粉。

果樹授粉越來越多地使用果園蜜蜂（春季梅森蜜蜂，Osmia屬）。根據英國作家克里斯托弗·奧圖爾（ChristopherO'Toole）在他的著作《紅梅森蜂》（TheRedMasonBee）中的說法，紅蜂是果園作物（在歐洲）比蜜蜂更有效的傳粉媒介。O.rufa和O.cornuta都在歐洲使用，而在北美西部，“藍果園蜜蜂”（Osmialignaria，比藍色更黑）是一種經過驗證的果園傳粉媒介。在日本，日本果園蜜蜂——角面蜂，Osmiacornifrons—提供高達80%的蘋果授粉。除了日本，在美國東部也越來越多地使用角蜂草，因為與其他石蜂一樣，它的效率是蜜蜂的100倍——每公頃只需要600只角面蜂，而不是數萬只的蜜蜂。家庭種植者可能會發現這些在郊區更容易接受，因為它們很少刺痛。

授粉不足的癥狀是蘋果小而畸形，成熟緩慢。可以對種子進行計數以評估授粉情況。授粉良好的蘋果質量xxx，會有七到十顆種子。少于三粒種子的蘋果通常不會成熟，會在初夏從樹上掉下來。授粉不足可能是由于缺乏授粉者或授粉者，或開花期授粉天氣不佳所致。通常需要多次蜜蜂訪問才能提供足夠的花粉粒以完成完全授粉。

像蘋果一樣，梨是自交不親和的，需要吸引昆蟲才能授粉并結出果實。與蘋果的一個顯著區別是，梨花顏色較淺，氣味較淡，對蜜蜂的吸引力要小得多。蜜蜂可能會放棄梨花去參觀蒲公英或附近的蘋果園。梨樹的大部分傳粉者是蜜蜂，盡管飛蠅和食蚜蠅也會造訪梨。在一些地區，例如意大利的艾米利亞-羅馬涅地區，由于1990年代火疫病的蔓延，蜜蜂無法用于為梨授粉，以及Osmiacornuta被用作傳粉媒介。對抗蜜蜂對梨花的低吸引力的一種方法是使用蜜蜂引誘劑來引誘蜜蜂為花朵授粉。蜜蜂引誘劑可能包括模仿育雛信息素或幼體信息素的信息素，或其他引誘劑。還有其他方法可以將蜜蜂吸引到梨花上。一是飽和授粉，也就是說，無論對蜜蜂的吸引力如何，都要儲存如此多的蜜蜂，使所有地區的花朵都開花。另一種方法是延遲蜂箱進入果園，直到開花約30%。蜜蜂在夜間被轉移到果園，通常會在梨花中逗留幾個小時，直到它們發現更豐富的花蜜來源。每英畝推薦的蜂箱數量為一。