小馬蹄蝠過著孤獨的生活方式，除了在秋季出生的幼崽出生之前的時期。在此期間，10到100只動物（主要是雌性）聚集在一起撫養幼崽。在冬天，馬蹄蝠喜歡獨處，但與其他人靠近。小型馬蹄蝠是久坐不動的動物，它們只能在夏季和冬季棲息地之間移動5-10公里。

在105到111kHz范圍內的回聲定位幫助下捕獲獵物。聲音的持續時間為20-30毫秒。它類似于其他蝙蝠的聲音，類似于唧唧聲。

小型馬蹄蝠的主要敵人是陸生（松貂、家貓）和空中掠食者，如鷹、貓頭鷹和其他大型鳥類。對于空中捕食者來說，馬蹄蝠更容易受到攻擊，因為它們飛行緩慢，不依賴視覺，而是依賴回聲定位。

它們主要以蚊子、蒼蠅和甲蟲等小昆蟲為食。回聲定位用于檢測獵物。與大型馬蹄蝠(Rhinolophusferrumequinum)不同，小型馬蹄蝠進食時間要長得多。在飛行過程中，他們更喜歡離地面5m的距離。

主要食性昆蟲23科7目。從四月到九月，馬蹄蝠以鱗翅目、雙翅目和神經翅目昆蟲以及蜘蛛為食。食物是在水體附近或潮濕地區獲得的。

他們在夏天繁殖。4月初，雌性和一些雄性組成了10-100只動物的群體。懷孕持續67天。幼崽于六月中旬至七月初出生，體重1.8克，第10天睜眼。哺乳期持續4周，幼崽在7周后完全獨立。父母團體在八月解散。

在野外的預期壽命是3-4年。圈養記錄的xxx年齡為21歲。

較小的馬蹄蝠在古北區的西部和中部很常見。它們遍布所有歐洲國家。在北非，分布范圍包括摩洛哥、阿爾及利亞、突尼斯，在東非也有分布。生活在海拔2000米以下。

較小的馬蹄蝠在其分布范圍的北部很少。在歐洲，夏季殖民地數量為10-50只蝙蝠（有時高達1500只）。該物種已從荷蘭、比利時和德國北部消失，除了巴伐利亞、薩克森-安哈爾特、圖林根和薩克森、波西米亞北部和西部以及波蘭的一些地區的少數殖民地，在喀爾巴阡山脈和克拉科夫仍然很常見高地，但在全國范圍內它被認為是瀕臨滅絕的。在瑞士和奧地利，在海拔超過400米的地方，種群被保存在碎片中。在西班牙由于建筑物的建造，一些殖民地消失了。在法國北部，小型馬蹄蝠的數量正在減少，盡管在南部被認為是穩定的。

亞洲和非洲的人口趨勢未知。