模糊復合物

模糊復合物是蛋白質復合物，其中存在結構模糊性或多重性，是生物功能所必需的。構象模糊區域的改變、截斷或去除會影響相應復合物的活性。模糊的復合體一般由本質上無序的蛋白質形成。結構上的多重性通常是蛋白質復合物功能上的多重性的基礎，遵循模糊的邏輯。核糖體的不同結合模式也被認為是模糊性的一個特殊情況。

近50年來，分子生物學基于兩個教條：（i）將蛋白質的生物功能等同于獨特的三維結構；（ii）假設蛋白質復合物具有精致的特異性。特異性/選擇性是由蛋白質與其配體（另一種蛋白質、DNA、RNA或小分子）之間形成的一套毫不含糊的相互作用來保證的。然而，許多蛋白質復合物包含功能上重要/關鍵的區域，這些區域在復合物中保持高度動態或采取不同的構象。這種現象被定義為模糊性。最相關的例子是細胞周期蛋白依賴性激酶抑制劑Sic1，它以磷酸化依賴的方式與Cdc4的SCF亞單位結合。磷酸化后沒有獲得規則的二級結構，不同的磷酸化位點在復合物中互換。

蛋白質復合物的結構模糊性涵蓋了一個廣泛的范圍。在多態復合物中，蛋白質與同一伙伴結合時采取兩種或更多不同的構象，這些構象可以被解決。夾層、側翼和隨機復合體是動態的，其中模糊的構象相互交換，無法解決。模糊復合體中的相互作用通常是由短的動機介導的。只要氨基酸組成保持不變，側翼區域就能容忍序列的變化，例如在連接組蛋白C端域和H4組蛋白N端域的情況下。

模糊區域通過瞬時的相互作用調控結合界面的構象平衡或靈活性。動態區域也可以與結合點競爭或將其拴在目標上。通過進一步的相互作用，或翻譯后的修飾，模糊區域的修飾會影響結合親和力或特異性。替代剪接可以調節模糊區的長度，從而導致復合物上的背景依賴性結合（如組織特異性）。