生物醫學調查本體論（OBI）是一個開放的、綜合的本體論，用于描述生物和臨床調查。OBI為調查的設計、使用的協議和儀器、使用的材料、產生的數據和對其進行的分析類型提供了一個模型。該項目是作為OBO基金會的一部分而開發的，因此遵守了其中的所有原則，如正交覆蓋（即與其他基金會成員本體的明確劃分）和使用共同的形式語言。在OBI中，使用的通用形式語言是網絡本體語言（OWL）。截至2008年3月，該本體的預發布版本已在項目的SVN庫中提供。

生物醫學調查本體（OBI）解決了對受控詞匯的需求，以支持實驗數據的整合和聯合（跨組學）分析，這一需求最初由FGED協會在轉錄組學領域確定，該協會開發了MGED本體作為微陣列數據的注釋資源。SmithB,AshburnerM,RosseC,BardJ,BugW,CeustersW,等（2007年11月）。OBOFoundry：本體的協調演變以支持生物醫學數據整合。自然-生物技術》。25(11):1251-5.doi:10.1038/nbt1346.PMC2814061.PMID17989687。OBI使用基本的形式本體上層本體作為描述不屬于特定問題領域的一般實體的手段。因此，所有的OBI類都是一些BFO類的子類。本體的范圍是對所有的生物醫學調查進行建模，因此包含以下方面的本體術語。

儀器（和其中的部分儀器）--例如DNA微陣列、離心機信息內容--例如圖像或數字信息實體，例如電子病歷調查的設計和執行（以及其中的個別實驗）--例如研究設計。電泳材料分離數據轉換（包括數據規范化和數據分析等方面）--例如主成分分析降維、平均值計算本體中還涵蓋了一些"具體"的方面，例如一個特定的實體在特定場景中可能發揮的作用（例如一個化學化合物在實驗中的作用）和一個實體的功能（例如胃的消化功能對身體的營養）。

MGED本體論最初是由FGED協會在轉錄組學領域確定的，是為了解決數據整合的需要而開發的。在相互決定合作之后，這項工作后來成為FGED、PSI和MSI等團體之間更廣泛的合作，以應對轉錄組學、蛋白質組學和代謝組學等領域的需求，FuGO（功能基因組學調查本體論）就這樣產生了。這后來成為涵蓋所有生物醫學調查的更廣泛范圍的OBI。作為一個國際性的、跨領域的倡議，OBI聯盟吸取了來自不同領域的專家，而不僅限于生物學。目前的OBI聯盟成員名單可在OBI聯盟的網站上找到。該聯盟由一個協調委員會組成，該委員會由兩個分組組成，即社區代表（代表一個特定的生物醫學社區）和核心開發者（本體論開發者，可能是也可能不是任何一個社區的成員）。與協調委員會分開的是開發者工作組，該工作組由各社區內的開發者組成，由目前OBI聯盟成員決定合作開發OBI。

BrinkmanRR,CourtotM,DeromD,FostelJM,HeY,LordP,etal.（2010年6月）。用OBI對生物醫學實驗過程進行建模。JournalofBiomedicalSemantics.1Suppl1:S7.doi:10.1186/2041-1480-1-S1-S7.PMC2903726.PMID20626927.CourtotM,BugWJ,GibsonF,ListerAL,MaloneJ,SchoberD,BrinkmanRR,RuttenbergA(1January2008).生物醫學調查的OWL。第五屆"貓頭鷹"研討會論文集：經驗與方向》，第432頁。

CiteSeerX10.1.1.142.9206.ZhengJ,ManduchiE,StoeckertJrCJ(7July2013).基于生物醫學調查本體論的β細胞基因組學應用本體論的開發(PDF)。ICBO:62-67.DumontierM,BakerCJ,BaranJ,CallahanA,ChepelevL,Cruz-ToledoJ,etal.（2014年3月）。用于生物醫學研究和知識發現的語義科學綜合本體（SIO）。分子方法Databa實驗室協議標準研討會。