巴氏消毒法或巴氏殺菌法是一種食品保存過程，其中包裝和非包裝食品（如牛奶和果汁）經過溫和加熱處理，通常低于 100 °C（212 °F），以消除病原體 并延長保質期。 該過程旨在破壞或使導致食物變質或疾病風險的微生物和酶失活，包括營養細菌，但大多數細菌孢子在該過程中存活下來。

該過程以法國微生物學家路易斯·巴斯德 (Louis Pasteur) 的名字命名，他在 1860 年代的研究表明，熱處理可以使葡萄酒中不需要的微生物失活。 在巴氏殺菌過程中，腐敗酶也會失活。 如今，巴氏殺菌廣泛應用于乳制品行業和其他食品加工行業，以實現食品保鮮和食品安全。

到 1999 年，大多數液體產品都在連續系統中進行熱處理，可以使用板式熱交換器或直接或間接使用熱水和蒸汽來加熱。 由于溫度適中，經過處理的食品的營養品質和感官特性會發生輕微變化。 帕斯卡化或高壓處理 (HPP) 和脈沖電場 (PEF) 是非熱過程，也用于對食品進行巴氏殺菌。

自公元 1117 年以來，為保存目的而加熱葡萄酒的過程在中國就已為人所知，并在日本的日記 Tamonin-niki 中有所記載，該日記由 1478 年至 1618 年間的一系列僧侶撰寫。

很久以后，在 1768 年，意大利牧師兼科學家拉扎羅·斯帕蘭扎尼 (Lazzaro Spallanzani) 進行的研究證明，可以在熱處理后使產品無菌。 Spallanzani 將肉湯煮了一個小時，煮沸后立即密封容器，發現肉湯沒有變質，也沒有微生物。 1795 年，一位名叫 Nicolas Appert 的巴黎廚師兼糖果商開始嘗試保存食品的方法，并在湯、蔬菜、果汁、乳制品、果凍、果醬和糖漿方面取得了成功。 他將食物放在玻璃罐中，用軟木塞和封蠟密封，然后放入沸水中。 同年，法國軍方提供 12,000 法郎的現金獎勵，獎勵一種新的食品保存方法。 經過大約 14 或 15 年的實驗，阿佩爾提交了他的發明并于 1810 年 1 月獲獎。同年晚些時候，阿佩爾發表了 L'Art de conserver les substances animales et végétales（保存動植物物質的藝術）。 這是xxx本關于現代食品保存方法的食譜。

位于巴黎附近馬西鎮的 La Maison Appert（英語：The House of Appert）成為世界上xxx家食品裝瓶廠，將各種食品保存在密封瓶中。 阿珀特的方法是用各種產品裝滿厚實的大口玻璃瓶，從牛肉和家禽到雞蛋、牛奶和準備好的菜肴。 他在瓶子的頂部留有空間，然后用虎鉗將軟木塞牢牢地密封在罐子里。 然后用帆布包裹瓶子以保護它，同時將其浸入沸水中，然后煮沸阿佩特認為適合徹底煮沸內容物的時間。 阿佩特為他的方法申請了專利，有時為了紀念他而被稱為 appertisation。

阿珀特的方法簡單易行，很快就得到了廣泛應用。 1810 年，同樣是法國血統的英國發明家和商人彼得·杜蘭德為自己的方法申請了專利，但這次是在錫罐中，因此開創了現代罐頭食品工藝。 1812 年，英國人 Bryan Donkin 和 John Hall 購買了這兩項專利并開始生產蜜餞。 僅僅十年后，阿佩特的罐頭制作方法就傳到了美國。 直到 20 世紀初，錫罐生產才普遍，部分原因是在 1855 年羅伯特葉茨發明開罐器之前需要錘子和鑿子來打開罐頭。

法國化學家路易斯·巴斯德 (Louis Pasteur) 于 1864 年在阿爾布瓦 (Arbois) 的暑假期間開發了一種不太激進的方法。

為了彌補當地陳釀葡萄酒經常出現的酸味，他通過實驗發現，將新釀葡萄酒短時間加熱至約 50–60°C（122–140°F）就足以殺死微生物，而且 隨后可以在不犧牲最終質量的情況下對葡萄酒進行陳釀。 為了紀念巴斯德，這個過程被稱為巴氏殺菌。 巴氏消毒法最初被用作防止葡萄酒和啤酒變酸的方法，牛奶經過巴氏殺菌需要很多年。 在 1870 年代的美國，在對牛奶進行監管之前，牛奶通常含有旨在掩蓋變質的物質。

牛奶是微生物生長的極佳培養基，當它在環境溫度下儲存時，細菌和其他病原體很快就會繁殖。