遺傳指紋分析（也稱為 DNA 指紋）是確定個體 DNA 特征的過程。 旨在識別物種而非個體的 DNA 分析稱為 DNA 條形碼。

遺傳指紋分析是刑事偵查中的一種取證技術，將犯罪嫌疑人的畫像與DNA證據進行比對，從而評估其參與犯罪的可能性。 它還用于親子鑒定、確定移民資格以及家譜和醫學研究。 遺傳指數分析也被用于動物學、植物學和農業領域的動植物種群研究。

從 20 世紀 80 年xxx始，科學進步允許使用 DNA 作為識別個人身份的材料。 杰弗里·格拉斯伯格 (Jeffrey Glassberg) 于 1983 年根據他在美國洛克菲勒大學 (Rockefeller University) 1981 年所做的工作，于 1983 年申請了xxx項直接使用 DNA 變異進行取證的專利 (US5593832A)。

英國遺傳學家Alec Jeffreys爵士于1984年在萊斯特大學遺傳學系工作時，獨立開發了遺傳指標分析的流程，從而首次將遺傳指標分析應用于刑事案件中。

該流程由 Jeffreys 與法醫科學服務處 (FSS) 的 Peter Gill 和 Dave Werrett 共同開發，首次用于法醫偵破 1983 年和 1986 年在萊斯特郡納爾伯勒 (Narborough) 被強奸和謀殺的兩名青少年的謀殺案 . 在偵探大衛·貝克 (David Baker) 領導的謀殺案調查中，自愿從約 5,000 名愿意協助萊斯特郡警察局調查的當地男子那里采集的血樣中所含的 DNA，導致最初的嫌疑人理查德·巴克蘭 (Richard Buckland) 無罪釋放 1988 年 1 月 2 日，Colin Pitchfork 被定罪。Pitchfork 是當地一家面包店的員工，他強迫他的同事 Ian Kelly 代替他提供血樣——然后 Kelly 使用偽造的護照冒充 Pitchfork . 另一名同事向警方報案。 Pitchfork 被捕，他的血液被送到 Jeffrey 的實驗室進行處理和檔案開發。 干草叉的輪廓與兇手留下的 DNA 相符，證實了干草叉在兩個犯罪現場的存在； 他對這兩起謀殺案供認不諱。

盡管 99.9% 的人類 DNA 序列在每個人身上都是相同的，但足夠多的 DNA 是不同的，以至于可以將一個人與另一個人區分開來，除非他們是同卵（同卵）雙胞胎。 遺傳指數分析使用高度可變的重復序列，稱為可變數目串聯重復序列 (VNTR)，特別是短串聯重復序列 (STR)，也稱為微衛星和小衛星。 VNTR 基因座在密切相關的個體之間是相似的，但變化如此之大以至于無關的個體不太可能具有相同的 VNTR。

當獲得血液或唾液等樣本時，DNA 只是樣本中存在的一小部分。 在分析 DNA 之前，必須將其從細胞中提取并純化。 有許多方法可以實現這一點，但所有方法都遵循相同的基本過程。 需要打破細胞膜和核膜，使 DNA 在溶液中游離。 一旦 DNA 游離，它就可以與所有其他細胞成分分離。 在溶液中分離出 DNA 后，可以將剩余的細胞碎片從溶液中去除并丟棄，只留下 DNA。 最常見的 DNA 提取方法包括有機提取（也稱為苯酚氯仿提取）、Chelex 提取和固相提取。 差異提取是提取的改進版本，其中來自兩種不同類型細胞的 DNA 在從溶液中純化之前可以相互分離。 每種提取方法在實驗室中都很有效，但分析人員通常會根據成本、所用時間、提取的 DNA 數量和提取的 DNA 質量等因素來選擇他們喜歡的方法。

RFLP 代表限制性片段長度多態性，在 DNA 分析方面，描述了一種 DNA 測試方法，該方法利用限制性內切酶在整個樣本中將 DNA 切割成短而特定的序列。 要在實驗室開始處理，樣品必須首先通過提取方案，這可能因樣品類型和/或實驗室 SOP（標準操作程序）而異。 一旦從樣品中的細胞中提取了 DNA 并與外來細胞物質和任何會降解 DNA 的核酸酶分離，就可以將樣品引入所需的限制酶，以將其切割成可辨別的片段。 酶消化后，進行 Southern 印跡。