松柏目松柏目松柏目松柏綱松柏目松柏目包括所有現存的針葉樹。 顯著特征是所有松柏目產生的被稱為圓錐體的生殖結構。 所有現存的針葉樹，如雪松、芹菜松、柏樹、冷杉、杜松、落葉松、松樹、紅木、云杉、紅豆杉和南洋杉（猴尾樹或猴拼圖樹）都包括在這里。 然而，一些化石針葉樹屬于松柏門內的其他不同目。

多項分子研究表明該目相對于麻麻屬是并系的，研究將麻麻目恢復為松科的姊妹組，或者比松科派生更多但與該組的其他成員是姊妹。

Brown (1825) 首先辨別出有兩組種子植物，根據胚珠是暴露的、直接接受花粉的還是封閉的，以種子發育的形式區分的。 不久之后，Brongniart (1828) 創造了 Phanérogames 裸子植物一詞來描述前者。 林德利 (Lindley) (1830) 隨后正式確定了這種區別，將他所稱的雙子葉植物亞綱分為兩個部落，即裸子植物和被子植物。 在裸子植物（或裸子植物科）中，Lindley 包括兩個目，Cycadeae 和 Coniferae。 在他的最后一部作品（1853 年）中，他將 Gymnogens 描述為一個有四個目的類；

• 蘇鐵科 (cycads)
• 松科（針葉樹）
• 紫杉科（taxads）
• 菱科

相比之下，Bentham 和 Hooker (1880) 通過將分類單元包括在針葉樹科中，僅將三個目包括在裸子植物綱中；

• 菱科
• 針葉樹
• 蘇鐵科

在恩格勒系統（1903）中，裸子植物被列為一個細分（Unterabteilung），并采用了更多的分裂方法，包括已滅絕的類群，有以下六個類別；

• 蘇鐵植物
• 貝內蒂泰爾斯
• 科達目
• 銀杏
• 針葉樹
• 涅塔列斯

在此期間，Gorozhankin 發表了關于裸子植物的論文（1895 年），為此他擁有松柏目，Gorozh 的植物學權威。

• 蘇鐵科
• Peucideae（針葉樹科）

20 世紀最常用的分類法維護了一個由兩組組成的系統，皮爾格 (Pilger) (1926) 對恩格勒系統進行了修訂，他將裸子科的 12 個科分為 2 個綱；

• 針葉樹目 (Coniferae)
• 涅塔列斯

在 20 世紀的大部分時間里，人們都遵循將裸子植物分為兩組的處理方法，盡管它們的組成和名稱各不相同，包括 Chamberlain (1935)、Benson (1957) 和 Cronquist (1960) 的系統。

在后者中，克朗奎斯特將裸子植物分為兩個部分；

• 針葉植物科
  • 針葉類
  • Chlamydospermae (Gnetales) 類
• 蘇鐵科
  • 蘇鐵科

Benson，（1957）提出松柏目一詞，將裸子植物分為四綱；

• Conopsida（針葉樹，包括松柏目）
• 麻黃綱
• 網翅目
• 蘇鐵科

在后來的修訂中，克朗奎斯特與另外兩位分類學家合作（1966 年），將所有裸子植物合并為一個科，即松下植物門，其中三個細分反映了主要譜系；

• 蘇鐵科
• 松果
• 葡萄科

在分子系統發育學時代，De-Zhi等（2004）再次提出將12個裸子植物科分為兩個綱；

• 蘇鐵綱
  • 訂購蘇鐵
• 針葉綱
  • 亞類 Multinervidae（6 目）
  • 分類Taxidae
    • 訂購紫杉
    • 訂購松柏目

隨著被子植物系統發育組的發展，陸生植物的線性分類發生了重大調整，Chase 和 Reveal (2009)。 在這個系統中，陸生植物形成一個類，Equisetopsida s.l.。 (sensu lato) 或 sensu Chase & 揭示，也稱為胚胎植物或胚胎植物。 illeg.. Equisetopsida s.l. 類 分為14個亞科作為亞綱，包括木蘭科（被子植物）。 裸子植物由這些亞綱中的四個代表，將它們置于與被子植物的姐妹群關系中。 子類（訂單數量）；

• 亞類 Cycadidae Pax (1)
• 子類 Ginkgooidae Engl。 (1)
• Gnetidae Pax 亞類 (3)
• 亞類 Pinidae Cronquist，Takht。 & 齊默姆。 （針葉樹）(1)

裸子植物 (Acrogymnospermae) 分類學一直被認為是有爭議的，并且缺乏共識。