原生質體（源自古希臘語 πρωτ?πλαστο? (protóplastos) 'first-formed'），是 Hanstein 于 1880 年創造的一個生物學術語，指代整個細胞，不包括細胞壁。 可以通過機械、化學或酶促方法從植物、細菌或真菌細胞中剝離細胞壁來生成原生質體。

原生質體與原生質球的不同之處在于它們的細胞壁已被完全去除。 原生質球保留了部分細胞壁。 例如，在革蘭氏陰性細菌原生質球的情況下，細胞壁的肽聚糖成分已被去除，但外膜成分尚未去除。

細胞壁由多種多糖構成。 可以通過使用適當的多糖降解酶的混合物降解細胞壁來制備原生質體：

在細胞壁消化期間和之后，原生質體變得對滲透壓非常敏感。 這意味著細胞壁消化和原生質體儲存必須在等滲溶液中進行，以防止質膜破裂。

原生質體可用于研究膜生物學，包括大分子和病毒的攝取。 這些也用于體細胞克隆變異。

原生質體廣泛用于 DNA 轉化（用于制造轉基因生物），因為否則細胞壁會阻止 DNA 進入細胞。 在植物細胞的情況下，原生質體可以首先通過生長成發育成愈傷組織的植物細胞群，然后通過使用植物組織培養方法從愈傷組織再生芽（成胚）而再生成完整的植物。 原生質體生長成愈傷組織和芽再生需要組織培養基中植物生長調節劑的適當平衡，而組織培養基必須針對每種植物進行定制。 與來自維管植物的原生質體不同，來自苔蘚的原生質體，例如 Physcomitrella patens，不需要植物激素來再生，它們在再生過程中也不會形成愈傷組織。 相反，它們直接再生為絲狀原絲體，模仿發芽的苔蘚孢子。

原生質體也可用于植物育種，使用一種稱為原生質體融合的技術。

使用電場或聚乙二醇溶液誘導來自不同物種的原生質體融合。 該技術可用于在組織培養中產生體細胞雜交體。

此外，在某些細胞中表達熒光蛋白的植物原生質體可用于熒光激活細胞分選 (FACS)，其中僅保留發出選定波長熒光的細胞。 除其他事項外，該技術用于分離特定的細胞類型（例如，從葉子中分離保衛細胞，從根中分離柱周細胞）以進行進一步研究，例如轉錄組學。