微生物或微生物是一種微觀大小的生物體，它可以以單細胞形式存在，也可以作為細胞群存在。

從古xxx始就懷疑可能存在看不見的微生物生命，例如公元前六世紀印度的耆那教經文。 微生物的科學研究始于 1670 年代安東·范·列文虎克 (Anton van Leeuwenhoek) 在顯微鏡下對微生物的觀察。 1850年代，路易斯·巴斯德發現微生物導致食物腐敗變質，推翻了自然生成理論。 1880 年代，羅伯特·科赫 (Robert Koch) 發現微生物會導致肺結核、霍亂、白喉和炭疽等疾病。

因為微生物包括來自所有三個生命領域的大多數單細胞生物，所以它們可能極其多樣化。 三個領域中的兩個，古生菌和細菌，只包含微生物。 第三個域真核生物包括所有多細胞生物以及作為微生物的許多單細胞原生生物和原生動物。 有些原生生物與動物有關，有些與綠色植物有關。 還有許多多細胞生物是微觀的，即微型動物、一些真菌和一些藻類，但這些通常不被認為是微生物。

微生物可以有非常不同的棲息地，從兩極到赤道、沙漠、間歇泉、巖石和深海，無處不在。 有些適應極端條件，例如極熱或極冷的條件，有些適應高壓，還有少數適應高輻射環境，例如耐輻射奇異球菌。 微生物也構成了所有多細胞生物體內和體表的微生物群。 有證據表明，34.5 億年前的澳大利亞巖石中曾經含有微生物，這是地球上生命最早的直接證據。

微生物在許多方面對人類文化和健康都很重要，它們用于發酵食物和處理污水，以及生產燃料、酶和其他生物活性化合物。 微生物作為模式生物是生物學中必不可少的工具，已被用于生物戰和生物恐怖主義。 微生物是肥沃土壤的重要組成部分。 在人體中，微生物構成了人體微生物群，包括必需的腸道菌群。 導致許多傳染病的病原體是微生物，因此是衛生措施的目標。

在 17 世紀發現微生物之前，人們已經討論了微生物可能存在的許多世紀。 到公元前六世紀，當今印度的耆那教徒假設存在一種叫做 nigodas 的微小生物。 據說這些 nigodas 成簇出生； 它們無處不在，包括植物、動物和人的身體； 他們的生命只有幾分之一秒。 根據耆那教領袖 Mahavira 的說法，人類在這些 nigoda 進食、呼吸、坐下和移動時大規模地摧毀了它們。 許多現代耆那教徒斷言馬哈維亞的教義預示著現代科學發現的微生物的存在。

最早提到微生物的是印度教經文，如公元前 1200 年至公元前 1000 年編纂的《阿闥婆吠陀》(Atharvaveda)，其中 Rishi Kanva 將微生物稱為 Kirmis。 他和他的后代 Yamadagnni 和 Agasti 一起創作了 mantra suktas，強調微生物感染和治愈它們的可能方法。

Righi Agastya 在 Rig Veda 中寫了一段咒語，提到了兩種對人體有害的生物。 xxx個是可見的，第二個非常小，肉眼看不見。

Ved Vyas Mahabharata 的 Shanti Parva 提到了非常微小的生物體，它們無法用肉眼看到，只能推斷。

有許多生物是如此微小，以至于它們的存在只能被推斷出來。 單是眼瞼的衰竭，它們就被摧毀了。

最早已知的表明疾病可能通過未見過的生物傳播的想法是羅馬學者馬庫斯·特倫蒂烏斯·瓦羅 (Marcus Terentius Varro) 在公元前一世紀的一本名為《論農業》的書中提出的，他在書中稱未見過的生物為小動物，并警告不要在附近建立家園 沼澤：

……而且因為有一些肉眼看不見的微小生物，它們漂浮在空氣中，通過口鼻進入人體，導致嚴重的疾病。

在醫學經典 (1020) 中，阿維森納提出肺結核和其他疾病可能具有傳染性。

Akshamsaddin（土耳其科學家）在 Antonie van Leeuwenhoek 通過實驗發現微生物之前大約兩個世紀，在他的作品 Maddat ul-Hayat（生命的物質）中提到了微生物：

認為疾病在人類身上一種一種出現是不正確的。 疾病通過從一個人傳播到另一個人而感染。 這種感染是通過種子發生的，這些種子非常小，肉眼看不見，但卻是活的。