植物解剖學或植物解剖學是研究植物內部結構的總稱。 最初它包括植物形態學，描述植物的物理形態和外部結構，但自 20 世紀中葉以來，植物解剖學被認為是一個單獨的領域，僅涉及植物內部結構。 植物解剖學現在經常在細胞水平上進行研究，并且通常涉及組織切片和顯微鏡檢查。

一些植物解剖學研究使用系統方法，根據植物的活動進行組織，例如養分運輸、開花、授粉、胚胎發生或種子發育。 其他的更經典地分為以下結構類別：

花解剖學，包括花萼、花冠、雄蕊屬和雌蕊屬植物的研究葉解剖學，包括表皮、氣孔和柵欄細胞的研究莖解剖學，包括莖結構和維管組織、芽和莖尖果實/種子解剖學，包括胚珠的結構， 種子、果皮和副果木材解剖學，包括樹皮、軟木、木質部、韌皮部、維管形成層、心材和邊材以及枝條的結構根部解剖學，包括根、根尖、內皮層的結構

大約在公元前 300 年，Theophrastus 撰寫了許多植物論文，其中只有兩篇留存下來，植物探究 (Περ? φυτ?ν ?στορ?α) 和植物成因 (Περ? φυτ?ν α?τι?ν)。 他發展了植物形態和分類的概念，這些概念經不起文藝復興時期的科學審查。

瑞士醫生和植物學家 Gaspard Bauhin 將二項式命名法引入植物分類學。 他于 1596 年出版了 Pinax theatri botanici，這是xxx個使用該慣例命名物種的人。 他的分類標準包括自然關系或“親和力”，這在許多情況下是結構性的。

正是在 1600 年代后期，植物解剖學才成為一門現代科學。 意大利醫生兼顯微鏡學家馬塞洛·馬爾皮吉 (Marcello Malpighi) 是植物解剖學的兩位創始人之一。 1671 年，他發表了他的《植物解剖學》(Anatomia Plantarum)，這是自亞里士多德以來植物生理配子學的xxx個重大進展。 另一位創始人是英國醫生尼希邁亞格魯。 他于 1672 年發表了植物哲學史的想法，并于 1682 年發表了植物解剖學。格魯被認為是對植物細胞的認識，盡管他稱它們為“囊泡”和“膀胱”。 他正確地識別和描述了植物（花）的性器官及其部分。

十八世紀，卡爾林奈建立了基于結構的分類學，他早期的工作是植物解剖學。 雖然被認為在科學上對比較和區分有效的確切結構水平隨著知識的增長而變化，但基本原則是由林奈建立的。 他于 1753 年發表了他的代表作《植物物種》。

1802 年，法國植物學家 Charles-Fran?ois Brisseau de Mirbel 發表了 Traité d'anatomie et de physiologie végétale（植物解剖學和生理學論文），開創了植物細胞學科學。

1812 年，Johann Jacob Paul Moldenhawer 發表了 Beytr?ge zur Anatomie der Pflanzen，描述了植物組織的顯微研究。

1813 年，瑞士植物學家 Augustin Pyrame de Candolle 發表了《植物學理論》(Théorie élémentaire de la botanique)，其中他認為植物解剖學而非生理學應該是植物分類的xxx基礎。 他以科學為基礎，建立了定義和分離植物屬的結構標準。

1830 年，Franz Meyen 發表了 Phytotomie，這是對植物解剖學的xxx篇綜合評論。

1838年德國植物學家Matthias Jakob Schleiden發表了Contributions to Phytogenesis，指出低等植物均由一個細胞組成，而高等植物則由（許多）單個細胞組成，從而證實并延續了米爾貝爾的工作。

德裔波蘭植物學家 Eduard Strasburger 描述了植物細胞的有絲分裂過程，并進一步證明新的細胞核只能從其他預先存在的細胞核的分裂中產生。 他的 Studien über Protoplasma 于 1876 年出版。

德國植物學家 Gottlieb Haberlandt 研究植物生理學并根據功能對植物組織進行分類。 在此基礎上，他于 1884 年出版了 Physiologische Pflanzenanatomie（生理植物解剖學），其中他描述了十二種類型的組織系統（吸收、機械、光合作用等）。

英國古植物學家 Dunkinfield Henry Scott 和 William Crawford Williamson 在 19 世紀末描述了植物化石的結構。 斯科特的《化石植物學研究》于 1900 年出版。

繼查爾斯達爾文的物種起源之后，加拿大植物學家愛德華查爾斯杰弗里正在研究不同維管植物群的比較解剖學和系統發育。