MADS 盒是一個保守的序列基序。 含有該基序的基因稱為MADS盒基因家族。 MADS 框編碼 DNA 結合 MADS 結構域。 MADS 結構域結合與稱為 CArG 盒的基序 CC[A/T]6GG 高度相似的 DNA 序列。 MADS 結構域蛋白通常是轉錄因子。 不同研究者報道的MADS盒長度有所不同，但典型長度在168-180個堿基對范圍內，即編碼的MADS結構域長度為56-60個氨基酸。 有證據表明，MADS 結構域是從所有現存真核生物的共同祖先的 II 型拓撲異構酶的序列延伸進化而來的。

xxx個被鑒定的 MADS 盒基因是來自釀酒酵母的發芽酵母 ARG80，但當時并未被認為是一個大基因家族的成員。 MADS 盒基因家族的名字后來作為四個創始成員的首字母縮寫詞而得名，忽略了 ARG80：

• 來自發芽酵母釀酒酵母的 MCM1，
• 來自擬南芥擬南芥的 AGAMOUS，
• 來自金魚草金魚草的缺陷，
• 來自人類智人的 SRF。

在 A. thaliana、A. majus 和 Zea mays 中，該基序與花的發育有關。 對這些模式被子植物的早期研究是對一般花結構的分子進化及其在非開花植物中的作用的研究的開始。

在幾乎所有研究的真核生物中都檢測到 MADS 盒基因。 雖然動物和真菌的基因組通常只有大約一到五個 MADS 盒基因，但開花植物的基因組有大約 100 個 MADS 盒基因。區分了兩種類型的 MADS 結構域蛋白； SRF 樣或 I 型 MADS 結構域蛋白和 MEF2 樣（在 MYOCYTE-ENHANCER-FACTOR2 之后）或 II 型 MADS 結構域蛋白。 動物和真菌中的 SRF 樣 MADS 結構域蛋白具有第二個保守結構域，即 SAM（SRF、ARG80、MCM1）結構域。 動物和真菌中的 MEF2 樣 MADS 結構域蛋白將 MEF2 結構域作為第二個保守結構域。 在植物中，MEF2 樣 MADS 結構域蛋白也被稱為 MIKC 型蛋白，指的是它們的保守結構域結構，其中 MADS (M) 結構域后跟一個干預 (I)、一個角蛋白樣 (K) 和一個 C 端域。 在植物中，MADS 結構域蛋白形成四聚體，這被認為是其功能的核心。 解析了 MADS 結構域蛋白 SEPALLATA3 的四聚化結構域的結構，說明了四聚體形成的結構基礎

耶拿大學的 Günter Thei?en 是一位深入研究 MADS 盒基因的遺傳學家。 例如，他和他的同事利用這些基因表明，麻雀目與針葉樹的關系比與開花植物的關系更密切。

截至 2021 年，MADS 盒對小麥的研究不足。

在玉米中，突變體 Tunicate1 產生莢玉米。 Tunicate1 是 Z. mays MADS19 (ZMM19) 的突變體，屬于 SHORT VEGETATIVE PHASE 基因家族。 ZMM19 可以異位表達。

ZMM19 在擬南芥中的這種異位表達擴大了萼片，表明保護。

MADS盒基因具有多種功能。 在動物中，MADS 盒基因參與肌肉發育和細胞增殖和分化。 真菌的功能范圍從信息素反應到精氨酸代謝。

在植物中，MADS 盒基因參與控制發育的所有主要方面，包括雄性和雌性配子體發育、胚胎和種子發育，以及根、花和果實發育。

一些開花植物的 MADS 盒基因與動物的 HOX 基因一樣具有同源異型功能。 根據花發育的 ABC 模型，花同源 MADS 盒基因（如 AGAMOUS 和 DEFICIENS）參與確定花器官身份。

MADS 盒基因的另一個功能是決定開花時間。 在擬南芥中，MADS 盒基因 SOC1 和開花基因座 C (FLC) 已被證明在分子開花時間通路的整合中具有重要作用。

這些基因對于正確的開花時間至關重要，并有助于確保在xxx繁殖潛力時進行受精。

MADS 盒蛋白質結構的特征在于四個結構域。 N 末端是高度保守的 MADS DNA 結合域。 MADS 結構域旁邊是適度保守的介入 (I) 和角蛋白樣 (K) 結構域，它們參與特定的蛋白質-蛋白質相互作用。 羧基末端 (C) 結構域是高度可變的，參與異二聚體和多聚體蛋白質復合物的轉錄激活和組裝。