在生態學中，生物相互作用是指生活在一個社區中的一對生物相互之間產生的影響。 它們可以是同一物種（種內相互作用），也可以是不同物種（種間相互作用）。 這些影響可能是短期的，如授粉和捕食，也可能是長期的； 兩者都經常強烈影響所涉及物種的進化。 長期的相互作用稱為共生。 共生的范圍從對雙方都有利的互利共生到對雙方都有害的競爭。 交互可以是間接的，通過共享資源或共同敵人等中介。 這種類型的關系可以通過基于因關系產生的對兩種生物的個體影響的凈效應來顯示。

最近的幾項研究表明，棲息地改變和共生等非營養性物種相互作用可能是食物網結構的重要決定因素。 然而，目前尚不清楚這些發現是否適用于整個生態系統，以及非營養相互作用是否隨機影響食物網，或影響特定的營養水平或功能組。

盡管生物相互作用或多或少是單獨研究的，但 Edward Haskell (1949) 對這一主題給出了一種綜合方法，提出了共同作用的分類，后來被生物學家采納為相互作用。 密切和長期的互動被描述為共生； 互惠互利的共生關系稱為共生關系。

短期相互作用，包括捕食和授粉，在生態學和進化中極為重要。 就單次互動的持續時間而言，這些都是短暫的：捕食者殺死并吃掉獵物； 傳粉者將花粉從一朵花轉移到另一朵花； 但就它們對雙方進化的影響而言，它們是極其持久的。 結果，合作伙伴共同發展。

在捕食中，一個生物體（捕食者）殺死并吃掉另一個生物體（它的獵物）。 捕食者適應并且通常高度專門用于狩獵，具有敏銳的感官，如視覺、聽覺或嗅覺。 許多食肉動物，包括脊椎動物和無脊椎動物，都有鋒利的爪子或下顎來抓住、殺死和切碎它們的獵物。 其他適應性包括提高狩獵效率的隱身和攻擊性模仿。 捕食對獵物具有強大的選擇性作用，導致它們發展出反捕食者適應性，例如警告著色、警報呼叫和其他信號、偽裝和防御刺和化學物質。 至少自寒武紀以來，捕食一直是進化的主要驅動力。

在過去的幾十年里，微生物學家發現了許多迷人的微生物，它們通過捕食其他微生物而得以生存。 幾個最好的例子是 Daptobacter (Campylobacterota)、Bdellovibrio 和 Vampirococcus 屬的成員。

Bdellovibrios 是活躍的獵手，它們活躍地游動著，游來游去尋找易感的革蘭氏陰性細菌獵物。 感應到這樣的細胞后，蛭弧菌細胞會游得更快，直到它與獵物細胞相撞。 然后它在獵物的外膜上鉆一個洞，進入周質空間。 隨著它的生長，它形成一條長絲，最終形成隔膜并產生后代細菌。 獵物細胞的裂解釋放出新的蛭弧菌細胞。 蛭弧菌不會攻擊哺乳動物細胞，并且從未觀察到革蘭氏陰性獵物細菌獲得對蛭弧菌的抗性。

這引起了人們對使用這些細菌作為益生菌來治療感染傷口的興趣。 盡管尚未嘗試過，但可以想象，隨著耐抗生素病原體的增加，這種治療形式可能被認為是可行的替代方案。

在授粉過程中，包括昆蟲（昆蟲性）、一些鳥類（鳥類）和一些蝙蝠在內的傳粉者將花粉從雄花部分轉移到雌花部分，從而實現受精，以換取花粉或花蜜作為回報。 伙伴們在地質時代共同進化； 就昆蟲和開花植物而言，共同進化已經持續了 1 億多年。

昆蟲授粉的花朵以形狀結構、鮮艷的顏色、圖案、氣味、花蜜和粘性花粉來吸引昆蟲，引導它們采集和存放花粉，并獎勵它們的服務。 像蜜蜂這樣的傳粉昆蟲適合通過顏色、圖案和氣味來檢測花朵，收集和運輸花粉（例如后腿上的剛毛形狀形成花粉籃），以及收集和加工花蜜（在蜂蜜的情況下） 蜜蜂、制作和儲存蜂蜜）。 相互作用每一側的適應性與另一側的適應性相匹配，并且已經通過自然選擇對其授粉有效性進行了塑造。