• 厘摩

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    厘摩

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    遺傳學中,厘摩(縮寫為 cM)或圖譜單位 (m.u.) 是測量遺傳連鎖的單位。 它被定義為染色體位置(也稱為基因座或標記)之間的距離,對于該距離,單代中干預染色體交叉的預期平均數為 0.01。 它通常用于推斷沿染色體的距離。 但是,這不是真正的物理距離。

    與物理距離的關系

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    它對應的堿基對數量在整個基因組中差異很大(染色體的不同區域具有不同的交叉傾向),并且還取決于發生交叉的減數分裂是否是卵子發生的一部分(染色體的形成) 雌性配子)或精子發生(雄性配子的形成)。

    一個厘摩平均對應于人類約 100 萬個堿基對。 這種關系只是粗略的,因為對應于一個厘摩的物理染色體距離在基因組中因位置而異,并且在男性和女性之間也有所不同,因為女性配子形成期間的重組比男性更頻繁。 孔等。 計算得出女性基因組長4460 cM,而男性基因組只有2590 cM長。 惡性瘧原蟲的平均重組距離為每厘摩約 15 kb:由 15 kb DNA(15,000 個核苷酸)分隔的標記具有每代 0.01 的預期染色體交叉率。 請注意,非同線基因(位于不同染色體上的基因)本質上是不連鎖的,并且 cM 距離不適用于它們。

    與重組概率的關系

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    因為僅當兩個標記之間存在奇數個染色體交換時才檢測到兩個標記之間的基因重組,所以以厘摩為單位的距離并不完全對應于基因重組的概率。 假設 J. B. S. Haldane 的映射函數,其中染色體交叉的數量根據泊松分布分布,d 厘摩的遺傳距離將導致奇數的染色體交叉,因此可檢測到基因重組,概率為

    P(重組 | d cM 的連接)= ∑ k = 0 ∞ P(2 k + 1 交叉 | d cM 的連接){\displaystyle \ P({\text{重組}}|{\text{ }}d{\text{ cM}})=\sum _{k=0}{\infty }\ P(2k+1{\text{ crossovers}}|{\text{ }}d{\text{ cM}})}= ∑ k = 0 ∞ e ? d / 100 ( d / 100 ) 2 k + 1 ( 2 k + 1 ) ! = e ? d / 100 sinh ? ( d / 100 ) = 1 ? e ? 2 d / 100 2 , {\displaystyle {}=\sum _{k=0}{\infty }e{-d/ 100}{\frac {(d/100){2\,k+1}}{(2\,k+1)!}}=e{-d/100}\sinh(d/100 )={\frac {1-e{-2d/100}}{2}}\,,}

    其中 sinh 是雙曲正弦函數。 對于較小的 d 值,重組概率約為 d/100,隨著 d 趨于無窮大,重組概率接近 50%。

    厘摩

    該公式可以倒過來,給出以厘摩為單位的距離作為重組概率的函數:

    d = 50 ln ? ( 1 1 ? 2 P ( 重組 ) ) 。 {\displaystyle d=50\ln \left({\frac {1}{1-2\ P({\text{recombination}})}}\right)\,.}

    詞源

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    厘摩是由 J. B. S. Haldane 為紀念遺傳學家 Thomas Hunt Morgan 而命名的。 然而,其母公司摩根如今已很少使用。

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    1. 厘摩
    2. 與物理距離的關系
    3. 與重組概率的關系
    4. 詞源

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