真核起始因子3
編輯真核起始原因3 (eIF3) 是一種多蛋白復合物,在真核翻譯的起始階段發揮作用。 它對于大多數形式的帽依賴和帽獨立翻譯啟動是必不可少的。 在人類中,eIF3 由 13 個不同的亞基 (eIF3a-m) 組成,總分子量約為 800 kDa,使其成為xxx的翻譯起始因子。 eIF3 復合體在真核生物中廣泛保守,但單個亞基的保守性因生物體而異。
函數
編輯eIF3 刺激翻譯啟動的幾乎所有步驟。 eIF3 似乎也參與翻譯的其他階段,例如回收,它促進終止后核糖體的分裂。 在 uORF 后重新啟動的特殊情況下,eIF3 可能通過延伸和終止與核糖體保持結合,以促進后續的啟動事件。 研究還表明,eIF3 通過與終止前復合物相互作用并干擾解碼,在酵母中的程序性終止密碼子通讀中發揮作用。
互動
編輯eIF3 在其溶劑側及其附近結合小核糖體亞基 (40S),并充當其他幾種起始因子、輔助因子 DHX29 和 mRNA 的支架。 eIF3 是多因子復合物 (MFC) 以及 43S 和 48S 預啟動復合物 (PIC) 的組成部分。 eIF3 與其他啟動因子的相互作用因物種而異; 例如,哺乳動物 eIF3 直接與 eIF4F 復合體相互作用(通過 eIF4G),而出芽酵母則缺乏這種聯系。 然而,哺乳動物和酵母 eIF3 都獨立地結合 eIF1、eIF4B 和 eIF5。
eIF3 的幾個亞基包含 RNA 識別基序 (RRM) 和其他 RNA 結合結構域,形成多亞基 RNA 結合界面,eIF3 通過該界面與細胞和病毒 IRES mRNA(包括 HCV IRES)相互作用。 eIF3 還被證明可以特異性結合 5'UTR 內的 m6A 修飾的 RNA,以促進不依賴于帽的翻譯。
出芽酵母 eIF3 的所有五個核心亞基以及其他幾個翻譯因子都存在于熱誘導應激顆粒中。
結構
編輯功能性 eIF3 復合物可以從天然資源中純化,或從重組表達的亞基中重建。 單個亞基的結構已通過 X 射線晶體學和 NMR 進行了表征,而復合物已通過冷凍 EM 進行了表征。 沒有完整的人類 eIF3 結構可用,但已在 43S PIC 的背景下以中等分辨率確定了近乎完整的復合體。 哺乳動物 eIF3 的結構核心通常被描述為具有擬人化特征的五葉顆粒,主要由 PCI/MPN 八聚體組成。 PCI 域以蛋白酶體帽 (P)、COP9 信號體 (C) 和 eIF3 (I) 之間的結構相似性命名,而 MPN 域則以與 Mpr1-PadI N 末端域的結構相似性命名。
信令
編輯eIF3 作為通過 S6K1 和 mTOR/Raptor 的細胞信號轉導的樞紐。 特別是,eIF3 在其非活性狀態下與 S6K1 結合,激活的 mTOR/Raptor 與 eIF3 結合并磷酸化 S6K1 以促進其從 eIF3 中釋放。 磷酸化的 S6K1 然后可以自由磷酸化其自身的許多靶標,包括 eIF4B,從而充當翻譯控制機制。
亞基
編輯eIF3 亞基在復合體中以相等的化學計量存在,但 eIF3J 除外,它松散結合并且對幾個物種的生存能力不是必需的。 亞基最初是按哺乳動物的分子量按字母順序排列的(A 最高),但分子量的排列因物種而異。
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