真菌病病毒（古希臘語：μ?κη? mykes（真菌）+ 拉丁語病毒），也稱為噬菌體，是感染真菌的病毒。 大多數真菌病毒具有雙鏈 RNA (dsRNA) 基因組和等距顆粒，但大約 30% 具有正義單鏈 RNA (+ssRNA) 基因組。

真正的真菌病毒表現出傳播感染其他健康真菌的能力。 許多在真菌中描述的雙鏈 RNA 元件不符合這種描述，在這些情況下，它們被稱為病毒樣顆粒或 VLP。 初步結果表明，大多數真菌病毒與其宿主共同分化，即它們的系統發育與主要宿主的系統發育基本一致。 然而，許多包含真菌病毒的病毒家族的樣本很少。 真菌病毒學是對真菌病毒的研究。 它是病毒學的一個特殊分支，旨在了解和描述真菌病毒的分類學、宿主范圍、起源和進化、傳播和運動及其對宿主表型的影響。

真菌病毒對真菌的經濟影響的xxx個記錄是在 20 世紀 40 年代后期在栽培蘑菇（雙孢蘑菇）中記錄的，被稱為拉法蘭西病。 霍林斯在異常的子實體中發現了三種以上不同類型的病毒。 這份報告基本上標志著真菌病毒學的開端。

La France 病也稱為 X 病、水紋病、枯死病和褐病。 癥狀包括：

• 產量下降
• 緩慢且異常的菌絲體生長
• 組織浸水
• 畸形
• 早熟
• 收獲后變質增加（保質期縮短）

蘑菇對病毒沒有抵抗力，因此控制僅限于衛生措施以阻止病毒傳播。

也許最著名的真菌病毒是 Cryphonectria parasitica hypovirus 1 (CHV1)。 CHV1 在真菌病毒研究中非常出色，因為它在歐洲成功地作為一種生物防治劑對抗真菌 C. parasitica（板栗疫病的病原體），而且還因為它是研究真菌弱毒力的模式生物。 然而，該系統僅在歐洲常規使用，因為歐洲大陸的植物相容性群體 (VCG) 數量相對較少。 相比之下，在北美，弱毒力表型的分布常常被阻止，因為不相容反應阻止真菌菌絲融合和交換其細胞質內容物。 在美國，至少發現了 35 個 VCG。 中國和日本似乎也存在類似情況，迄今已確定 71 個 VCG。

大多數真菌病毒具有雙鏈 RNA (dsRNA) 基因組和等距顆粒，但大約 30% 具有正義單鏈 RNA (+ssRNA) 基因組。 然而，也描述了陰性單鏈RNA病毒和單鏈DNA病毒。 更新后的第 9 次 ICTV 病毒分類報告列出了 90 多種真菌病毒，涵蓋 10 個病毒科，其中 20% 未分配給一個屬，在某些情況下甚至沒有分配給一個科。

與剛性桿狀、彎曲桿狀、棒狀顆粒、包膜桿狀顆粒和皰疹病毒樣病毒相比，等距形式在真菌病毒形態中占主導地位。 基因組數據的缺乏通常會阻礙對已經建立的病毒群進行最終歸類，或者無法建立新的科和屬。 后者適用于許多未包殼的 dsRNA 病毒，這些病毒被認為是病毒性的，但缺失的序列數據到目前為止阻止了它們的分類。 到目前為止，Partitiviridae、Totiviridae 和 Narnaviridae 科的病毒在真菌病毒領域占據主導地位。

真菌病毒在真菌中很常見 (Herrero et al., 2009)，并且存在于真正真菌的所有四個門中：壺菌門、接合菌門、子囊菌門和擔子菌門。 真菌經常感染兩種或多種不相關的病毒以及有缺陷的 dsRNA 和/或衛星 dsRNA。 還有一些病毒只是簡單地使用真菌作為載體并且與真菌病毒不同，因為它們不能在真菌細胞質中繁殖。

通常假設真菌病毒的天然宿主范圍僅限于密切相關的植物兼容性組或允許細胞質融合的 VCG，但一些真菌病毒可以在分類學上不同的真菌宿主中復制。 很好的例子是在兩種真菌 S. homoeocarpa 和 Ophiostoma novo-ulmi 中發現的有絲分裂病毒。 努斯等人。 (2005) 描述了使用體外病毒轉染技術可以將寄生梭菌低病毒 1 (CHV1) 的天然宿主范圍擴展到與寄生梭菌密切相關的幾種真菌物種。