多核變形蟲屬是一種巨型鞭毛變形蟲，通常長 500-800 微米，但偶爾可達 5 毫米，見于停滯淡水池塘或緩慢流動的溪流的厭氧或微氧底部沉積物中。

該屬由R. Greeff于1874年創建，以多核變形蟲屬palustris為模式種。 在多核變形蟲屬建立后的幾十年里，研究人員為它分配了許多新物種。 然而，在 20 世紀的最后 25 年，研究人員將該屬縮減為單一物種，多核變形蟲屬 palustris，它被認為是一種高度多變的生物，具有復雜的生命周期，其各個階段被誤認為是不同的物種 . 所有描述的物種都被降級為同義詞，或移至不相關的混沌屬。

自 2004 年以來，四個新的多核變形蟲屬物種被描述，兩個較舊的物種被重新描述并確認為該屬的有效成員。 這些發展對多核變形蟲屬沼澤植物本身的性質提出了新的問題。

多核變形蟲屬有多個細胞核，在極少數情況下數量可以從兩個到數千個不等。 移動細胞呈圓柱形，前面有一個半球形偽足，后面有一個稱為尿路的半xxx突起，上面覆蓋著微小的非運動鞭毛。 它們吃各種各樣的食物，并且有許多液泡，其中既含有硅藻等食物，也含有沙子等碎屑。 多核變形蟲屬依賴于共生細菌，這些共生細菌的功能類似于好氧生物的線粒體，使厭氧物種能夠生活在更有氧的環境中。

近幾十年來，多核變形蟲屬的分類一直是廣泛討論的主題。

多核變形蟲屬缺乏線粒體，以及通常在真核細胞中發現的其他幾種細胞器（特別是過氧化物酶體和網狀體）。 曾幾何時，人們還認為它們缺乏鞭毛并且不能進行有絲分裂。 由于有核細胞幾乎沒有真核生物的所有其他細胞內含物，多核變形蟲屬一度被視為幸存的原始真核生物，介于細菌和現代細胞之間。 1973年，有人提出，多核變形蟲屬palustris的祖先在線粒體出現之前就已經從真核生物系中分支出來。1976年，Jean M. Whatley寫道，多核變形蟲屬palustris可能被認為是最原始的真核生物。 生活在今天。 因此，該生物體可能是祖先真核生物的現代類似物，根據連續內共生理論，它內化了后來演化為現代細胞線粒體的細菌共生體。 已知該物種擁有多種細菌共生體。 雖然這些的功能尚不清楚，但 Whatley 認為它們可能提供了一個有用的進化示例，表明可能已經實現細菌線粒體轉化的方式。

1982 年，Lynn Margulis 為缺乏無足體的厭氧變形蟲創建了 Caryoblastea（或 Pelobiontidae）亞綱，并將多核變形蟲屬歸為該亞綱的xxx成員。 次年，Cavalier-Smith 將該屬與其他幾種原始線粒體變形蟲納入一個新的分類群：古變形蟲。 反過來，古變形蟲與其他線粒體真核生物、元單胞菌和微孢子蟲一起被招募到新的始祖動物王國。

多核變形蟲屬的原始性在 1988 年受到質疑，當時 Joe I. Griffin 發表了多核變形蟲屬 palustris 的結構研究，表明該物種畢竟擁有基本的鞭毛，并且它確實有絲分裂。 格里芬斷定，多核變形蟲屬既不是原始的，也不是與相關的形式不同，一旦意識到它的親戚是變形蟲鞭毛蟲。

1995年，反對多核變形蟲屬原始性的論據變得更加強烈，當時分子分析顯示多核變形蟲屬palustris的祖先很可能擁有線粒體。 到本世紀末，很明顯，卡瓦利埃-史密斯的原變形蟲的所有成員都起源于線粒體細胞。 換句話說，它們根本不是早期分支或原始真核生物，而是退化的原生生物，它們失去了祖先擁有的細胞器。

因此，多核變形蟲屬和其他變形蟲被重新分配到變形蟲門，在 Conosa 亞門下（與 Mycetozoan 粘液霉菌共享）。 Kingdom Archezoa被徹底消滅。