食物不耐癥是對食品、飲料、食品添加劑或食品中發現的化合物的一種有害反應，通常是延遲反應，會在一個或多個身體器官和系統中產生癥狀，但通常指除食物過敏以外的反應。 食物超敏反應泛指食物不耐受和食物過敏。

食物過敏是免疫反應，通常是由組胺釋放引起的 IgE 反應，但也包括非 IgE 免疫反應。 這種機制導致過敏通常會對食物產生即時反應（幾分鐘到幾小時）。

食物不耐癥可以根據其機制進行分類。 不耐受可能是由于缺乏消化食物所需的特定化學物質或酶，如遺傳性果糖不耐受。 這可能是身體吸收營養物質的能力異常的結果，如果糖吸收不良。 食物不耐癥反應可能發生在食物中天然存在的化學物質上，如水楊酸鹽敏感性。 來自植物的藥物，如阿司匹林，也會引起這些反應。

食物超敏反應泛指食物不耐受和食物過敏。 有多種早期術語已不再使用，例如假性過敏。

食物不耐癥反應可包括對食物或食物化合物的藥理、代謝和胃腸道反應。 食物不耐癥不包括心理反應或食源性疾病。

非過敏性食物過敏是一種異常的生理反應。 很難確定耐受性差的物質，因為反應可能會延遲、依賴于劑量，并且在許多食物中可能會發現特定的引起反應的化合物。

• 代謝性食物反應是由于營養物質代謝的先天性或后天性錯誤引起的，例如乳糖酶缺乏癥、苯丙酮尿癥和蠶豆病。
• 藥理學反應通常是由于低分子化學物質引起的，這些化學物質以天然化合物的形式出現，例如水楊酸鹽、胺和谷氨酸鹽，或者是食品添加劑，例如防腐劑、色素、乳化劑和增味劑。 這些化學物質能夠對易感人群造成類似藥物（生化）的副作用。
• 胃腸道 (GI) 反應可能是由于吸收不良或其他胃腸道異常所致。
• 免疫反應由非 IgE 免疫球蛋白介導，其中免疫系統將特定食物識別為異物。
• 毒素可能天然存在于食物中，由細菌釋放，或由食品污染引起。 有毒食物反應是由食物或物質在沒有免疫參與的情況下的直接作用引起的。
• 心理反應涉及臨床癥狀的表現，這些臨床癥狀不是由食物引起的，而是由與食物相關的情緒引起的。 當以無法識別的形式提供食物時，不會出現這些癥狀。

消除飲食有助于診斷食物不耐受。 有針對某些食物不耐受的特定診斷測試。

食物不耐癥更慢性，不那么急性，在表現上也不那么明顯，而且通常比食物過敏更難診斷。 食物不耐受的癥狀差異很大，可能會被誤認為是食物過敏的癥狀。 雖然真正的過敏與速效免疫球蛋白 IgE 反應有關，但可能很難確定導致食物不耐受的有害食物，因為反應通常會在很長一段時間內發生。 因此，致病因素和反應在時間上是分開的，可能沒有明顯的相關性。 食物不耐癥癥狀通常在進食或飲用相關食物后約半小時開始出現，但有時癥狀可能會延遲長達 48 小時。

食物不耐癥可單獨或聯合出現影響皮膚、呼吸道、胃腸道 (GIT) 的癥狀。 在皮膚上可能包括皮疹、蕁麻疹（蕁麻疹）、血管性水腫、皮炎和濕疹。 呼吸道癥狀可能包括鼻塞、鼻竇炎、咽部刺激、哮喘和干咳。 GIT 癥狀包括口腔潰瘍、腹部絞痛、惡心、脹氣、間歇性腹瀉、便秘、腸易激綜合征 (IBS)，并且可能包括過敏反應。

食物不耐癥已被發現與腸易激綜合癥和炎癥性腸病、慢性便秘、慢性丙型肝炎感染、濕疹、非甾體抗炎藥不耐受、呼吸道疾病（包括哮喘、鼻炎和頭痛）、功能性消化不良、嗜酸性粒細胞性食管炎以及耳鼻炎有關 喉嚨 (ENT) 疾病。

對飲食中化學成分的反應可能比真正的食物過敏更常見，盡管沒有證據支持這一點。 它們是由各種食物、動物和植物中天然存在的各種有機化學物質引起的。