玉髓是二氧化硅的隱晶質形式，由非常精細的石英和莫干石共生體組成。它們都是二氧化硅礦物，但它們的不同之處在于石英具有三角晶體結構，而莫干石是單斜晶系。玉璽的標準化學結構（基于石英的化學結構）是SiO2（二氧化硅）。玉髓呈蠟狀光澤，呈半透明或半透明狀。它可以呈現多種顏色，但最常見的顏色是白色到灰色、灰藍色或從淺色到近黑色的棕色陰影。

玉髓出現在廣泛的品種中。許多半寶石實際上是玉髓的形式。比較著名的玉髓品種如下：

瑪瑙是玉髓的一種，其特征是透明度或彩色圖案，例如多色彎曲或棱角條紋。不透明的品種有時被稱為碧玉。火瑪瑙在棕色背景上呈現虹彩現象；虹膜瑪瑙在光線（尤其是精確的光線）透過寶石時會呈現出異常的虹彩。風景瑪瑙是一種玉髓，含有多種不同的礦物雜質，使石頭看起來像風景。

紅玉髓（也拼寫為cornelian）是一種透明至半透明的紅棕色玉髓品種。它的色調可能從淡橙色到強烈的近乎黑色的顏色不等。與瑪瑙相似的是沙德，它是棕色而不是紅色。

綠玉髓（也拼寫為chrysophrase）是一種綠色的玉髓，已被氧化鎳著色。（綠玉髓顏色較深的品種也稱為綠玉髓。不過，綠玉髓一詞也用于描述綠色石英，在某種程度上是一種顏色描述符，而不是嚴格定義的礦物品種）。如果顏色足夠豐富，藍色玉髓有時被稱為藍色綠玉髓，盡管它的顏色源于銅的存在，并且在很大程度上與含鎳綠玉髓無關。

火瑪瑙是葡萄狀玉髓的一種，含有層狀鐵微粒，可產生虹彩效果。它可以顯示各種彩虹色，包括紅色、橙色、黃色、綠色、藍色和紫色。

天芥菜是一種綠色的玉髓，含有類似于血滴的紅色氧化鐵內含物，使天芥菜有了雞血石的別名。在類似的品種中，斑點是黃色的，被稱為血漿。

苔蘚瑪瑙含有綠色絲狀內含物，使其具有苔蘚或藍紋奶酪的表面外觀。還有樹瑪瑙，與苔蘚瑪瑙相似，只是呈純白色，帶綠色細絲，而苔蘚瑪瑙通常有透明底色，所以苔蘚呈現立體感。它不是瑪瑙的真正形式，因為它缺乏瑪瑙的同心帶定義特征。

鉻玉髓是一種綠色的玉髓，由鉻化合物著色。

瑪瑙是瑪瑙的變種，帶有黑白條紋。同樣，帶有棕色、橙色、紅色和白色條紋的瑪瑙被稱為纏絲瑪瑙。

在格陵蘭島，古新世火山巖層中發現了白色至灰色玉髓。這種淡藍色的玉髓是眾所周知的品種。因其顏色呈藍色，如冰一般，故有當地名稱“玉髓冰藍”。