質粒
編輯質粒 e 是小的,通常是環形的,自主復制的雙鏈 DNA 分子,可以存在于細菌和古細菌中,但不是細菌染色體的一部分(核等價物),即它們存在于染色體外。 因此,它們也被稱為染色體外元件 (ECE)。 質粒 e 也很少出現在真核生物中(例如面包酵母中的 2 微米環)。 它們的大小通常在 2 kbp 和 200 kbp 之間,在特殊情況下小于 1 kbp(小質粒)和超過 1000 kbp(大質粒),大質粒和小染色體之間的過渡是流動的。 古細菌中類似的染色體外 DNA 是 Borgs。
結構
編輯質粒e可以包含許多不同的基因。 介導這些基因 z。 B. 抗生素抗性,這可以導致宿主細菌的選擇性優勢。 每個質粒至少包含一個作為復制起點(ORI)的序列。 如果復制起點與細菌菌株相容,則質粒可以獨立于染色體 DNA 進行復制。 質粒因此自主復制(復制子)并被繼承。 根據復制起點的性質,細菌細胞中有很少或非常多的拷貝(高拷貝)。
在細菌中,附加體是質粒e,它可以整合到宿主生物體的染色體DNA中。 它們可以在那里停留很長時間,隨著宿主細胞的每次分裂而復制,甚至成為宿主 DNA 的組成部分。 然而,它們也可以像其他質粒一樣單獨存在。
真核生物中偶爾出現的病毒附加體,如乙型肝炎病毒的cccDNA或皰疹病毒、腺病毒的附加體,不整合到宿主的基因組中,但也存在于細胞核中。 一個例外是痘病毒的附加體,它出現在胞質溶膠中。 病毒附加體是免疫逃避持久性病原體感染的機制。
分類
編輯質粒en有兩個基本組,共軛和非共軛。 結合質粒含有所謂的 tra 基因,它可以觸發結合,即兩種細菌之間質粒的順性交換。 非共軛質粒沒有這種能力,但在共軛過程中可以隨著共軛質粒一起傳播。
不同的質粒類型可以共存于同一個細胞中,例如在大腸桿菌中。 B. 最多七個。 如果兩個質粒互不相容,其中一個就會被摧毀。 因此,根據在同一細胞中共存的能力,它們可以分為不相容組。
一種特殊類型的質粒是所謂的 Ti-質粒(腫瘤誘導),它傳輸轉移 DNA。 它們通常是某些細菌的組成部分,并被它們轉移到植物中。 在那里,它們會導致植物中xxx已知的癌癥。
IncP1 類型的質粒可以從細菌轉移到所有三個域的生物體。
使用
編輯質粒是分子生物學、遺傳學、生物化學以及其他生物和醫學領域的重要工具。 它們在基因工程中被稱為載體,用于復制或表達基因。 向量的有針對性的調整稱為向量設計。
它們源自天然存在的質粒en,并且仍然具有它們的結構成分,例如復制起點。 此外,它們經過修飾,可以輕松用于克隆:將要復制的基因插入質粒e中,質粒e具有抗生素抗性基因。 然后將這些質粒引入細菌中,細菌在經過適當抗生素處理的營養培養基上生長。 只有吸收了具有抗生素抗性信息質粒的細菌才能存活。 未吸收質粒的細菌被抗生素殺死。 抗生素作為一種選擇標記,只允許帶有抗性質粒的細菌存活。 將基因插入質粒通常會打斷另一個基因(報告基因),該基因將無法再表達。 這種缺失的特性可以用于篩選,因為只有那些吸收了所需基因的質粒的細菌不再具有這種特性。可大量獲得相應的基因產物。 該程序現在允許生產重組胰島素(即與人胰島素相同的胰島素),以前必須在費力的過程中從豬的胰腺中分離出來。
如果要將一段DNA導入生物體(細菌、植物、動物、人等),質粒e也可以作為載體(載體)。 在動物和人類中,這種方法僅適用于細胞培養中的細胞,因為細胞很容易以單層形式存在。 根據靶細胞的類型,轉移需要沉淀的 DNA(例如,通過內吞作用攝取質粒來修飾肌肉細胞)或脂質體中包裝的 DNA。 還有許多其他方法,例如電穿孔、基因槍、DNA 小環、病毒載體等等。 可進一步提高目標細胞的轉染效率(真核生物)或轉化效率(原核生物)。
可視化
編輯使用合適的方法,例如用鈾原子染色(BAC 擴散),可以使質粒 e 在電子顯微鏡下可見。 以 DNA 形式纏繞自身的質粒環狀結構具有拓撲后果。 質粒e可以以三種不同的形狀存在。 超螺旋形狀是質粒的自然構象。 由于 DNA 雙螺旋結構自身扭曲,無法在封閉的質粒中展開自身,因此產生了扭轉應力,導致質粒在空間中圍繞自身彎曲。 同樣的效果可以用電話線觀察到,電話線繞著自己的軸扭曲。 在開鏈形式中,兩條 DNA 鏈中的一條在一點斷裂(所謂的缺口),這意味著開鏈可以圍繞固定鏈自由旋轉; 這使扭應力松弛,質粒打開。 在線性 DNA 的情況下,兩條鏈都斷裂并且環狀結構被廢除。
染色體差異
編輯質粒en和染色體之間的區別并不容易。 一種定義指出質粒 e 比染色體小。 然而,z。 例如,苜蓿中華根瘤菌的質粒 pSymB 是肺炎支原體初級基因組的兩倍大。 另一個定義是質粒e不攜帶必需基因。 然而,什么是“必需基因”取決于生存環境。 另一個定義指出,質粒 e 在細胞中的拷貝數多于染色體。 然而,像大腸桿菌和許多其他大腸桿菌中的 F-質粒這樣的質粒存在的拷貝數與染色體相同。 染色體的一個重要特征是它的復制與細胞周期協調。
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